Resumo Os peixes da família Haemulidae estão atualmente distribuídos em 19 gêneros, com distribuição mundial em águas oceânicas tropicais e subtropicais. Brachygenys e Haemulon são importantes gêneros de peixes recifais do Brasil, visto que ocorrem em grandes cardumes, de valores ecológicos e comerciais. Este estudo identificou as espécies brasileiras dos gêneros Brachygenys e Haemulon usando o código de barras de DNA. Embora apenas uma única linhagem de Brachygenys chrysargyrea, Haemulon melanurum, H. parra e H. squamipinna tenha sido encontrada em nosso conjunto de dados, mais de uma unidade taxonômica operacional molecular (MOTU) foi identificada em H. atlanticus, H. aurolineatum e H. plumieri, indicando a possível existência de populações discretas ou espécies crípticas.

Abstract The fishes of the Haemulidae family are currently allocated to 19 genera with a worldwide distribution in the tropical and subtropical waters of the world’s oceans. Brachygenys and Haemulon are important genera of reef fish in Brazil, as they occur in large shoals, which are both ecologically and commercially valuable. This study identified the Brazilian species of the genera Brachygenys and Haemulon using DNA barcodes. While we found only a single lineage in Brachygenys chrysargyrea, Haemulon melanurum, H. parra, and H. squamipinna, more than one molecular operational taxonomic unit (MOTU) was identified in H. atlanticus, H. aurolineatum, and H. plumieri, indicating the possible existence of discrete populations or cryptic species.